Não eram ainda passados sete anos desde o início da Obra em Portugal, e já os Superiores Maiores, tendo em atenção o seu desenvolvimento, a erigiam em Região, a 12 de Outubro de 1954.
Região é um conjunto de comunidades de um território determinado que ainda não possui estruturas e número de membros suficientes de modo a poder evoluir de forma autónoma. O primeiro Superior Regional foi o P. Ângelo Colombo.

Em 1957, deu-se início, no Funchal, ao Colégio Infante D. Henrique, como residência para estudantes, numa quinta alugada, sita à Avenida do Infante. Tendo-se encontrado instalações satisfatórias no antigo Hotel Belmonte, na freguesia do Monte, para lá se transferiu o Colégio, iniciando-se as aulas a 1 de Outubro de 1958.

Em 1958, o seminário menor do Continente foi transferido de Aveiro para o Porto, na Rua Azevedo Coutinho (à Boavista). Aí funcionou durante alguns anos o Seminário Missionário Pe. Dehon.

Em 1963, alugava-se, em Ermesinde, um edifício para onde foram transferidos os alunos do Colégio S. João e, dois anos mais tarde, também os da Casa Santa Maria (Quinta da Abelheira - Vale de Loures). Assim tinha início o Seminário de Nossa Senhora de Fátima, destinado exclusivamente aos alunos do primeiro ciclo liceal, tendo funcionado apenas durante alguns anos.

No Porto inicia-se a construção do novo e grande edifício do Seminário Missionário Pe. Dehon, em Fânzeres (Gondomar). Aqui se instalaram, no início, todos os alunos do 1° ciclo. Mais tarde, em 1971, para lá se transferiram também os alunos do 2° ciclo, ficando a casa da Boavista destinada a Centro Vocacional e sede da Paróquia de Nossa Senhora da Boavista. Hoje, o Seminário Missionário P. Dehon funciona para cerca de uma centena de seminaristas do ciclo unificado.